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儿童髓母细胞瘤的阵列CGH分析

编辑:INC|发布时间:2019-10-14 17:27|点击次数:
  儿童髓母细胞瘤的阵列CGH分析(Array CGH Analysis of Pediatric Medulloblastomas)
 
  英文摘要:
  Brain tumors are the second most common childhood cancer. We used high-resolution array comparative genomic hybridization(aCGH) to analyze losses and gains of genetic material from 24 medulloblastomas. The bacterial artificial chromosome clones were ordered on the array, allowing for an average resolution of approximately 420 kilobases. The advantage of this high resolution is that the breakpoints associated with subregional chromosome copy number aberrations can be accurately defined, which in turn allows candidate genes within these regions to be readily defined. In this analysis, we confirmed the frequent involvement of loss of 17p and gain of 17q, although we have now established the position of the breakpoint that consistently lies in the chr17:18318880-19046234 region of the chromosome. Other frequent losses were seen on 8p, 10q, 16q, and 20p, and frequent gains were seen on 2p, 4p, 7, and 19. In addition, the fine-resolution mapping provided by aCGH made it possible to define small chromosome deletions in 1q23.3-q24.2, 2q13.12-q13.2, 6q25-qter, 8p23.1, 10q25.1, and 12q13.12-q13.2. Overall, amplification events were rare, the most common involving MYC (16%), on 8q, although isolated events were seen in 10p11 and 3q.
 
  中文摘要:
  脑瘤是第二常见的儿童癌症。我们使用高分辨率阵列比较基因组杂交技术(aCGH)分析了24个髓母细胞瘤的遗传物质的得失。细菌人工染色体克隆排列在阵列上,平均分辨率约为420千碱基。这种高分辨率的优点是,与次区域染色体拷贝数畸变相关的断点可以被精确定义,这反过来又使这些区域内的候选基因容易定义。在这次分析中,我们确认了17p的丢失和17q的获得的频繁参与,虽然我们现在已经确定了断点的位置,始终位于染色体的chr17:18318880-19046234区域。8p、10q、16q、20p出现其他频繁亏损,2p、4p、7、19出现频繁盈利。此外,aCGH所提供的精细定位使得在1q23.3-q24.2、2q13.12-q13.2、6q25-qter、8p23.1、10q25.1、12q13.12-q13.2中定义小的染色体缺失成为可能。总的来说,扩增事件是罕见的,在8q上较常见的涉及MYC(16%),尽管在10p11和3q中出现了孤立事件。
儿童髓母细胞瘤
 
  脑瘤是较常见的儿童实体瘤,年发病率约为百万分之五,总发病率仅次于白血病(Packer, 1990)。髓母细胞瘤是儿科较常见的脑肿瘤,是一种起源于小脑的侵袭性肿瘤。尽管有证据表明髓母细胞瘤是外周神经外胚层肿瘤(PNETs)的一部分,但基因表达谱显示它们可能是一种独特的肿瘤类型(Pomeroy et al., 2002)。5年的总存活率在50%-60%之间,尽管由于局部复发或转移,长期存活率下降到30%。传统上,预后是基于年龄、可能切除的范围和转移性疾病,尽管这些参数并不总是预测预后或指示具体的治疗。基于组织病理学的生存或预后的相关性已被提出,尽管它通常与分子标记联合支持(Eberhart et al.,2004;Lamont等,2004;Ozer等,2004;Ray等人,2004)。由于这个原因,已经有相当多的努力来识别辅助遗传标记作为预后指标(Biegel 1999)。
 
  在癌症发展的多阶段理论(Fearon and Vogelstein, 1990)中,提出癌症的发展是通过积累基因变化,为进化中的肿瘤提供选择性优势。重建这些事件假设早期事件发生在一个相对稳定的遗传背景下,高度不稳定的基因组反映了更高级的阶段。如果这对髓母细胞瘤是真的,那么从我们的研究来看,至少有两个事件可能被认为是“早期”的。“一些肿瘤显示出17p的损失/17q的增加,作为唯一的异常,这是一个早期的事件。6号染色体长臂的缺失也可以考虑。显然,本研究中分析的肿瘤数量太少,无法得出确切的结论,但使用aCGH定义的损失和收益的高分辨率定义为理解基因组中可能参与这些肿瘤发展的关键区域奠定了基础。
 
  INC国际神经外科医生集团旗下世界神经外科顾问团(WANG)成员James T. Rutka教授作为该研究的主要成员之一,在最近的临床研究上,教授又将重点集中在了儿童脑瘤的研究上,并取得了有效的成果。其实验室在研究脑肿瘤生长和侵袭的机制方面颇有成就,并在Sunnybrook健康科学中心和多伦多大学生物材料和生物医学工程研究所的合作下,正在设计一种基于纳米颗粒的输送系统,作为治疗脑瘤的一种新方法。

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