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英国科学家:间变性少突胶质瘤新的突变基因

栏目:神外前沿|编辑:INC|发布时间:2021-11-16 10:07|阅读: |
间变性少突胶质瘤是一种罕见的颅内原发性恶性肿瘤,预后变异较大。过去发现大部分AO都有染色体1p/19q缺失和IDH基因突变,认为PCV化疗对肿瘤有效,预后良好。伴随着高通量测序技术...

  间变性少突胶质瘤是一种罕见的颅内原发性恶性肿瘤,预后变异较大。过去发现大部分AO都有染色体1p/19q缺失和IDH基因突变,认为PCV化疗对肿瘤有效,预后良好。伴随着高通量测序技术的飞速发展,CIC、FUBP1和TERT启动子在AO中相继发现突变。近日,英国癌症研究所的KarimLabreche等人对AO进行了全外显子组和转录组的高通量测序,并在2015年6月的NatureComunication上发现了TCF12基因突变。

间变性少突胶质瘤新的突变基因

  本研究将51例AO按IDH和1p/19q状态分为三组:IDH野生型、1p/19q缺失IDH突变和1p/19q缺失IDH突变。对每组患者的肿瘤标本和血液标本进行基因测序,共发现4733个突变,平均每个AO有37个突变;体细胞突变率达到1.62/100万个碱基。大部分是C→T转换。

  英国科学家发现了间变性少突胶质瘤的新突变基因。

  FUBP1突变发现FUBP1突变,在11例CIC突变,在37例TERT启动子突变,类似于之前的报道。与此同时,研究人员在10%的病例(5/51)中发现了TCF12突变,这是一种碱性螺旋环结构(basichelix-loop-helix,bHLH)的转录因子12,在颅缝早闭症的文献中有报道。TCGA数据库中43例AO中有2例TCF12突变,采用生物信息学方法。另外83例AO测序,作者发现5例TCF12突变。因此,在本研究的134例(51+83)AO中,TCF12突变率为7.5%,而在75例WHOⅱ级少突胶质瘤中,TCF12突变率仅为1例。

  TCF12突变对肿瘤细胞的影响表明,TCF12基因突变可导致TCF12转录激活减少或转录TCF12与DNA结合率下降。TCF12下游目标基因活性下降(如E钙粘蛋白),免疫反应通路明显富集。除了在细胞核中表达外,无活性TCF12也在细胞质中表达。此外,TCF12突变肿瘤具有明显的栅栏样坏死和丝分裂特征,比野生肿瘤更具侵袭性。TCF12突变或TCF杂合性缺失有缩短生存期的倾向,但研究的生存分析没有统计意义。

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